L’agave utilizzata per la produzione della tequila Los Tres Toños viene coltivata nelle alture che dominano la città di Amatitan e trasportata entro poche ore in distilleria. L’agave viene cotta per lungo tempo in piccole botti di rovere ex-bourbon che subiscono una extra-tostatura, per dare al distillato una nota affumicata più marcata rispetto alle tequila esistenti in commercio. Dopo che la fermentazione di circa 48 ore è terminata, il mosto fermentato viene sottoposto ad una doppia distillazione in alambicchi di rame e di acciaio inossidabile.